Sonic the Hedgehog 3 2024 เป็นภาคต่อที่น่าตื่นเต้นจากหนังที่แฟนๆ รอคอย โดยเล่าเรื่องราวของการต่อสู้ระหว่าง Sonic กับ Shadow ที่กลับมาพร้อมกับพลังที่อันตรายกว่าเดิม เริ่มต้นจากเหตุการณ์ในปี 1974 เมื่ออุกกาบาตที่มีเม่นต่างดาวชื่อ Shadow ตกลงมาในโอคลาโฮมาและถูกกองทัพยึดครอง โดยมีศาสตราจารย์เจอรัลด์ โรบ็อตนิกที่ทำการทดลองต่างๆ กับ Shadow ที่ศูนย์ทหาร GUN ซึ่งในช่วงเวลานั้น Shadow ได้พัฒนาความสัมพันธ์อันแนบแน่นกับมาเรีย หลานสาวของเจอรัลด์ แต่คืนหนึ่งเหตุการณ์ที่ไม่คาดฝันเกิดขึ้น เมื่อมาเรียเสียชีวิตจากการระเบิดที่เกิดขึ้นขณะพวกเขาพยายามหลบหนี ศาสตราจารย์เจอรัลด์ถูกจำคุก ส่วน Shadow ถูกทำให้หยุดนิ่งและถูกกักขังไว้ในศูนย์ทหาร GUN เป็นเวลานานถึงห้าสิบปี
ในปี 2024 Shadow ได้รับการปลดปล่อยเมื่อมีการแฮ็กเข้าไปในระบบของ GUN และเขาตัดสินใจที่จะกลับมาเพื่อแก้แค้นในสิ่งที่เกิดขึ้นกับมาเรีย ในขณะเดียวกัน Sonic กำลังฉลองวันครบรอบการมาถึงของเขาบนโลกกับเพื่อนรักอย่าง Tails และ Knuckles รวมถึงพ่อแม่บุญธรรมของเขา Tom และ Maddie Wachowski ที่เมือง Green Hills รัฐมอนทาน่า แต่แล้วทีม Sonic ต้องพบกับภัยคุกคามใหม่ เมื่อ Rockwell จาก GUN มาถึงเพื่อคัดเลือกพวกเขาให้หยุดยั้ง Shadow ที่กำลังทำลายล้างในโตเกียวอน!